二氧化碳清理

要把二氧化碳去除掉，就得把消化槽里的生质汽散过喷水塔或喷石灰水塔。这步骤会把二氧化碳融化在水里，即收集在塔底。

收集的水之后被喷下第二个塔，为了使要释放二氧化碳及排泄到空气中。水又被再循环，继续融化了再排泄二氧化碳。

虽说不完全有从甲烷里排泄二氧化碳的必要，但是二氧化碳并没有所谓燃料的运用价值，更何况也有可能会牵涉到运用甲烷的仪器的设定等等。

当不同的原料进行发酵时，所产生的二氧化碳成份都不一样。这会时时影响到操作，所以二氧化碳也必须被去除，

在消化槽输出品质稳定的情况下，可无需排泄二氧化碳。那么仪器也必须调整，来适应总体较低的二氧化碳和甲烷混合体之燃料热量。这混合体的比例必须小心维护，才能确保仪器将来的正常操作。但是如果甲烷二氧化碳混合体是以燃料用在一个甲烷发电机组系统里，那混合体比例就可以较灵活点。这是因为这样的系统是能更加包容燃料素质的变换。

擦洗系统的操作压力相当低，所以必须让气体容易流通以便防止压力损失，导致整个系统的气体停止流通。系统的压力通常在0。5千帕到2。0千帕之间。既然大多数的仪器是在0。6到0。7千帕的压力下操作，那擦洗系统的压力绝对不能有太大的骚动。

一个需要擦洗二氧化碳的系统里是不能操作在低压力的情况下。反而，一系列或多级泵或压缩机需要增压二氧化碳擦洗过程，之后再压缩甲烷，储存在高压汽缸里。

这样的一个储存方式较贵，只有车辆才使用，让车辆方便地行带或储存甲烷。

一立方米的甲烷大约是一加仑或4。5公升汽油的能量。所以即使被压缩到12个大气层，一部车辆也许要多过一个甲烷铁钢。